Bugüne dek 51 kez katıldığı Türkiye Kupası organizasyonunda 6 şampiyonluğu bulunan sarı-lacivertli takım, 41 çeyrek final turunun 27'sinde yarı finale yükseldi.
1967-1968, 1973-1974, 1978-1979 ve 1982-1983 sezonlarının ardından 29 yıl hasret kaldığı kupada, 2011-2012 ve 2012-2013'te üst üste kazandıktan sonra, geçen sezon katıldığı ilk turda elenen "Sarı Kanaryalar", bu kez işi sıkı tutuyor.
Fenerbahçe, kupayı 1962-1963, 1964-1965, 1988-1989, 1995-1996, 2000-2001, 2004-2005, 2005-2006, 2008-2009 ve 2009-2010 sezonlarında olmak üzere 9 kez finallerde kaybetti.
Sarı-lacivertliler bu sezon 53'üncüsü düzenlenen organizasyona, 1998-1999 sezonunda cezası nedeniyle katılamamıştı.
Kupa performansı
Fenerbahçe'nin Türkiye Kupası tarihinde sezonlara göre elde ettiği dereceler ve oynadığı son turlarda aldığı sonuçlar şöyle:
| Sezon | Tur | Rakip | Skor (FB-Rakip) |
| 1962-63 | Final | Galatasaray | 1-2, 1-2 |
| 1963-64 | 3. tur | Ankaragücü | 0-2 |
| 1964-65 | Final | Galatasaray | 0-0, 0-1 |
| 1965-66 | Yarı Final | Galatasaray | 0-0, 1-3 |
| 1966-67 | Çeyrek Final | Samsunspor | 1-2, 0-0 |
| 1967-68 | Final | Altay | 2-0, 0-1 (Şampiyon) |
| 1968-69 | Yarı Final | Galatasaray | 1-2 |
| 1969-70 | 1. tur | İstanbulspor | 1-1, 0-1 |
| 1970-71 | Yarı Final | Eskişehirspor | 0-3, 1-0 |
| 1971-72 | Yarı Final | Altay | 0-1, 1-1 |
| 1972-73 | Yarı Final | Ankaragücü | 1-2, 1-0 |
| 1973-74 | Final | Bursaspor | 0-1, 3-0 (Şampiyon) |
| 1974-75 | Çeyrek Final | Trabzonspor | 1-1, 1-2 |
| 1975-76 | Çeyrek Final | Göztepe | 1-1, 1-2 |
| 1976-77 | Çeyrek Final | Trabzonspor | 0-2, 0-1 |
| 1977-78 | Çeyrek Final | Bursaspor | 1-2, 1-1 |
| 1978-79 | Final | Altay | 1-2, 2-0 (Şampiyon) |
| 1979-80 | Çeyrek Final | Lüleburgazspor | 0-0, 1-1 |
| 1980-81 | Yarı Final | Ankaragücü | 0-1, 1-1 |
| 1981-82 | Çeyrek Final | Galatasaray | 0-2, 2-2 |
| 1982-83 | Final | Mersin İdman Yurdu | 2-0, 2-1 (Şampiyon) |
| 1983-84 | Yarı Final | Beşiktaş | 0-0, 2-4 |
| 1984-85 | Çeyrek Final | Galatasaray | 1-2, 0-1 |
| 1985-86 | 5. tur | Sakaryaspor | 0-2 |
| 1986-87 | Çeyrek Final | Samsunspor | 0-1, 0-0 |
| 1987-88 | 6. tur | Sakaryaspor | 1-5, 1-2 |
| 1988-89 | Final | Beşiktaş | 0-1, 1-2 |
| 1989-90 | Yarı Final | Beşiktaş | 0-3 |
| 1990-91 | Yarı Final | Ankaragücü | 1-3 |
| 1991-92 | 6. tur | Kocaelispor | 0-1 |
| 1992-93 | Yarı Final | Beşiktaş | 0-1, 1-1 |
| 1993-94 | Çeyrek Final | Beşiktaş | 1-2 |
| 1994-95 | Yarı Final | Galatasaray | 1-1 (6-7 Penaltı) |
| 1995-96 | Final | Galatasaray | 0-1, 1-1 |
| 1996-97 | Çeyrek Final | Beşiktaş | 2-2, 1-2 |
| 1997-98 | Çeyrek Final | Trabzonspor | 2-1, 0-3 (Hükmen) |
| 1998-99 | Cezalı | ||
| 1999-00 | 3. tur | Pendikspor | 1-2 |
| 2000-01 | Final | Gençlerbirliği | 2-2 (1-4 Penaltı) |
| 2001-02 | 4. tur | Denizlispor | 1-2 |
| 2002-03 | 2. tur | Konyaspor | 0-1 |
| 2003-04 | Yarı Final | Gençlerbirliği | 2-4 |
| 2004-05 | Final | Galatasaray | 1-5 |
| 2005-06 | Final | Beşiktaş | 2-3 |
| 2006-07 | Yarı Final | Beşiktaş | 0-1, 1-1 |
| 2007-08 | Çeyrek Final | Galatasaray | 0-0, 1-2 |
| 2008-09 | Final | Beşiktaş | 2-4 |
| 2009-10 | Final | Trabzonspor | 1-3 |
| 2010-11 | Grupta elendi | ||
| 2011-12 | Final | Bursaspor | 4-0 (Şampiyon) |
| 2012-13 | Final | Trabzonspor | 1-0 (Şampiyon) |
| 2013-14 | 4. tur | Fethiyespor | 1-2 |